Cible de sévères critiques de la Cour des comptes selon des indiscrétions du journal Le Monde, l’Onema a décidé de réagir. Sa directrice générale Elisabeth Dupont Kerlan, indique que « les recommandations de la Cour seront, bien entendu, prises en compte », elle souligne n’avoir à ce jour aucune nouvelle de la plainte déposée par le Syndicat national de l’environnement (SNE).

L’Office national de l’eau et des milieux aquatiques confirme que la Cour des Comptes a effectué le contrôle de l’établissement sur les exercices 2007 à 2011, un contrôle « normal » exercé sur l’ensemble des organismes publics, précise l’Onema. Dans la tourmente, Elisabeth Dupont-Kerlan affirme qu’elle a témoigné aux agents de l’établissement de sa confiance soulignant, leurs compétences et leur attachement au métier et à la protection de l’eau et des milieux aquatiques.

Elisabeth Dupont-Kerlan a été nommée directrice générale de l’Onema fin octobre 2012, en remplacement de Patrick Lavarde.